- Агул (река)
- Ангара
- Белая (приток Ангары)
- Бирюса (река)
- Бодайбо (река)
- Большая Белая (приток Белой)
- Большая Ерёма
- Большая Олха
- Большая Тира
- Большой Патом
- Вакунайка
- Вача (река)
- Витим
- Голоустная
- Гутара
- Декимде
- Жуя
- Зима (река)
- Игирма (река)
- Икей (река)
- Илга
- Иликта
- Илим (приток Ангары)
- Иркут
- Ия (река)
- Казыр
- Карабула (река)
- Ката (река)
- Кая (приток Иркута)
- Кирей (река)
- Киренга
- Китой
- Кова (приток Ангары)
- Конкудера
- Коченга
- Куда
- Купа (приток Куты)
- Кута (река)
- Лена
- Малая Белая (приток Белой)
- Малая Олха
- Малый Патом
- Мама (река)
- Мамакан (река)
- Миня
- Моголь
- Молбо (река)
- Мура (приток Ангары)
- Мурин (приток Куды)
- Непа (река)
- Нижняя Тунгуска
- Ния (река)
- Ока (приток Ангары)
- Олха (река)
- Онот
- Пилюда
- Пойма (приток Бирюсы)
- Тагул
- Тасеева
- Таюра (река)
- Топорок (река)
- Туманшет (река)
- Тутура
- Тэтэрэ
- Уда (приток Тасеевой)
- Унга (приток Ангары)
- Урик
- Ушаковка (приток Ангары)
- Ханда (приток Киренги)
- Хомолхо
- Чара (приток Олёкмы)
- Чая (приток Лены)
- Чечуй
- Чона
- Чуя (приток Лены)
- Якурим
- Бабха (река)
- Безымянная (река, Иркутская область)
- Большая Половинная
- Большая Шумиха
- Култучная
- Лангатуй
- Паньковка (река, впадает в Байкал)
- Похабиха
- Слюдянка (река, Слюдянский район)
- Снежная (река)
- Солзан (река)
- Спусковая (река)
- Талая (река, впадает в Байкал)
- Утулик (река)
- Хара-Мурин
- Харлахта
- Шабартуй (река)
- Анга (река, впадает в Байкал)
- Бугульдейка (река)
- Сарма (река)