- Байдуковка
- Баржа (приток Немонинки)
- Большаковка
- Большая (приток Преголи)
- Большая Морянка
- Бударка (река)
- Витушка
- Гвардейская
- Гремячья
- Гурьевка (река)
- Дальняя (река, впадает в Куршский залив)
- Долгая (приток Луговой)
- Завитая (приток Инструча)
- Загорянка (приток Инструча)
- Залесинка (приток Головкинского канала)
- Засыпка (приток Ульяновки)
- Злая (река)
- Игнатьевка (приток Мамоновки)
- Ильичёвка (приток Деймы)
- Калиновка (река, впадает в Куршский залив)
- Камышевая
- Кривая (приток Немонинки)
- Кривуля (приток Голубой)
- Лаковка (приток Преголи)
- Мамоновка (река, впадает в Балтийское море)
- Молодёжный ручей
- Мучная (приток Залесинки)
- Мучная (приток Нельмы)
- Нельма (река, впадает в Балтийское море)
- Неман
- Немонин
- Овражная (приток Бударки)
- Окуневка (приток Ульяновки)
- Полевая (приток Инструча)
- Преголя
- Прямая (приток Бударки)
- Разлив (река, впадает в Балтийское море)
- Ржевка (приток Немонина)
- Садовая (приток Приморской)
- Свобода (река)
- Северная (рукав Немана)
- Скардупа (приток Буды)
- Старая Оса
- Старица (приток Матросовки)
- Тростянка (река, впадает в Балтийское море)
- Узкая (река, впадает в Балтийское море)
- Швента
- Широкая (приток Разлива)
- Шмаковка (приток Торфяной)
